国际莫尼卡学术成果奖
本会每三年评选一次“国际莫尼卡学术成果奖”，包括“国际莫尼卡医学成果奖”20名（在一千多篇医学学术论文中选出）和“国际莫尼卡心理学成果奖”10名（在五百多篇心理学学术论文中选出）。参选者主要为本会会员。目前已于1998年、2001年、2004年、2007年评选四届。
第五届（2010年）的评选包括：“国际莫尼卡医学成果奖”20名、“国际莫尼卡心理学成果奖”10名、“国际莫尼卡性学成果奖”10名。
国际莫尼卡人道主义奖
为了表彰本会在四川地震救灾工作有突出成绩的志愿者，IACMSP于2008年特增设国际莫尼卡人道主义奖。已评选的奖项类别为：国际莫尼卡人道主义杰出奖（团体奖3位、个人奖20人）国际莫尼卡人道主义援助奖（26人）、国际莫尼卡人道主义鼓励奖（66人）。
国际莫尼卡青年性学奖
为了表彰各国青年科技人员在人类性学（Human Sexuality）领域里的杰出成绩，国际华人医学家心理学家联合会和（美国）东西方性学研究所于2009年特设立“国际莫尼卡青年性学奖”，每两年评选一次。该奖授予在性学领域从事科研、教学和临床工作中有突出贡献的优秀青年科技工作者。首届国际莫尼卡青年性学奖获奖者为6人。